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尊龙凯时人生就是搏在核酸適體分子識別機制方面取得新進展

來源 :     時間 :2023-07-07

    

  近日 ,尊龙凯时人生就是搏李從剛研究團隊與中國科學院生態環境研究中心趙強等研究團隊合作 ,利用核磁共振方法解析了黃麴黴毒素B1的核酸適體的高分辨溶液結構 ,揭示了核酸適體高親和識別的分子機制 。相關研究發表在學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上 。  

  核酸適體是一類能特異性識別靶標的寡核苷酸片段 ,具有廣泛的靶標範圍 ,被譽為化學家的抗體 ,在生化傳感 、藥物開發等方面具有廣泛的潛在應用 。核酸適體的結構是理解其靶標識別機制 、優化改造核酸適體 、開發應用傳感檢測方法以及基於人工智能預測結構 、設計核酸適體的重要基礎 。然而 ,由於當前核酸適體的結構研究仍面臨很大挑戰 ,致使結構和識別機制研究相對匱乏 。 

  黃麴黴毒素是食品中常見的小分子污染物 ,該毒素存在20多種衍生物 ,其中黃麴黴毒素B1(Aflatoxin B1 ,AFB1)是目前發現的致癌性最強的天然毒素 ,被世界衛生組織的癌症研究機構劃定為Ι類致癌物, 嚴重威脅人類及動物的健康和生命安全 。因此AFB1的檢測對於食品安全 、環境監測至關重要 。具有26個鹼基的核酸適體AF26是小分子核酸適體領域為數不多的具有高親和力的代表 ,具有良好的應用前景 。然而,該適體高親和識別AFB1的分子機制一直不清楚 。 

  研究團隊通過液體核磁共振方法解析了適體AF26與AFB1複合物在溶液中的高分辨結構 ,闡釋了高親和識別的分子機制 。發現在沒有AFB1的情況下 ,游離的AF26適體可形成簡單的莖環結構(圖1) 。結合AFB1後 ,AF26上由16個殘基組成的環區完成從非結構態到結構態的自適應構象轉變 ,通過G·C配對以及G·G·C三聯體形成了一個發卡 、兩個凸環結構 。發卡和凸環合圍形成了AFB1的結合口袋 。AFB1上下被G·C配對和G·G·C三聯體夾擊 ,側面被五個未配對的T鹼基如同「腰帶」一樣纏繞 ,通過堆積 、供體原子-π 、疏水等相互作用緊密結合 。同時 ,研究人員也通過一系列突變對該結構進行了驗證 ,並且基於高分辨結構進一步闡釋了適體區分AFB1和其一個原子差別的同系物AFG1的分子機制 ,通過精準突變提升了適體對兩種毒素的區分能力 。該研究不僅有助於更好地理解適體的高親和識別機制 ,同時也為適體的設計 、修飾改造及應用開發奠定了重要的結構基礎 。 

  

  

  核酸適體AF26-AFB1複合物的高分辨核磁共振結構

     

  該研究以「Structural Basis for High-Affinity Recognition of Aflatoxin B1 by a DNA Aptamer」為題發表在學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上 ,尊龙凯时人生就是搏為該工作的第一完成單位 ,尊龙凯时人生就是搏研究員徐國華和博士生王晨 ,中國科學院生態環境研究中心博士生於皓為共同第一作者 ,研究員李從剛和中國科學院生態環境研究中心的研究員趙強為通訊作者 。   

  該研究工作得到了國家自然科學基金和科技部的項目支持 。 

  論文連結: http://doi.org/10.1093/nar/gkad541